解析：基因检测助力罕见病确诊

发布时间：2021-10-23 14:54:10 阅读：次来源：水箱厂家

曾经风靡一时的冰桶挑战,唤起了人们对于“渐冻症”的关注。“渐冻症”又称肌萎缩侧索硬化。2018年5月11日,国家卫生健康委员会等5部门联合制定了《第一批罕见病目录》,肌萎缩侧索硬化被收录其中。

罕见病又称“孤儿病”,由于单病种人群发病率低、病例分散等特点数控技术图文教程,长久以来罕见病研究处于医学研究的荒漠地带。目前,已知的罕见病已超过6000种,其中大部分罕见病与遗传相关,且几乎所有的单基因遗传病均属罕见病。

据估计,中国至少有1000万罕见病患者,面对如此庞大的患者群体,中国的罕见病诊断水平总体却并不高。就中国的现状而言,临床大夫对罕见病的认识不够、经验不足,无法将罕见病患者从大量患者中准确识别,很容易造成漏诊、误诊。

近年来,由于分子诊断技术的发展,罕见病的诊断取得了明显的进步。一方面,在传统基因检测技术的基础上,测序技术飞速发展,二代测序技术已经相对成熟,三代测序技术也已经上市。

相较于传统的基因检测技术,二代测序技术更加快速、经济。尤其是全基因组测序(WGS)和全外显子组测序(WES),克服了罕见病致病基因未知、突变类型多变的困难,为罕见病能得到及时、准确的基因诊断创造了条件。

基于二代测序的基因检测优点

不受遗传方式影响

提供致病基因的位置信息

提供致病突变的类型

二代基因组测序技术应用于罕见病诊断中可分为全基因组测序(WGS)、全外显子组测序(WES)和靶向目标基因测序。一项婴儿筛查研究表明,对于致病基因已知的单基因遗传病,WES能准确诊断57.5%的病人,远远高于标准诊断方法的准确率(13.75%)。

WES 虽然外显子仅占全基因组的1%,但是据推断约 85%的致病突变发生在该区域内。全外显子组测序(WES)通过二代测序技术获得全基因组外显子区域的DNA序列信息,结合临床表型和生物信息学分析,可推断出可能的致病基因。和全基因组测序(WGS)相比,WES 省去了基因中的非编码序列,需要的样本量相对较少,更加经济;与靶向目标基因测序相比,WES不需要提前预测致病基因,更适用于诊断困难的罕见病患者,因此受到许多临床医生的青睐。以派森诺医学的个人全外基因组检测为例,可筛查4000多项单基因遗传病。

WGS

WGS 是利用二代测序技术获得全基因组的序列信息。其对于单碱基变异、剪切位点突变、内含子变异、多拷贝数变异的识别较其他基因测序技术更为有效。与WES相比,WGS测量结果的一致性更好,偏倚更小。WGS的应用范围更广,尤其对于可能涉及内含子突变的疾病。

尽管存在挑战国标链条资料,高通量测序为罕见病的临床诊断和个性化医学带来了前所未有的机遇。相信随着对罕见病研究的不断深入、高通量测序技术的不断发展、变异数据库的建立以及相关法律法规的完善,高通量测序技术在罕见病临床分子诊疗领域的应用将逐步普及。